Layanan Berita Ekspres
CHENNAI: Meskipun 82 orang dinyatakan positif Covid-19 dengan penurunan gen ‘S’ (penanda varian Omicron), Tamil Nadu tidak dapat secara resmi memastikan jumlah kasus Omicron di negara bagian tersebut. Hal ini karena Laboratorium Kesehatan Masyarakat Negara Bagian, yang menyelesaikan pengurutan enam kontak positif dari satu-satunya pasien Omicron di TN, bukan bagian dari Konsorsium Genomik SARS-CoV-2 India dan hasilnya harus divalidasi oleh Institut Virologi Nasional di Pune. . Seorang pejabat senior kesehatan mengatakan laporan tersebut diperkirakan akan tiba pada hari Kamis.
“Negara bagian telah mengurutkan beberapa sampel di SPHL kampus DMS dan mengirimkannya ke NIV, Pune. Kami berharap mereka mengumumkan laporannya pada hari Kamis,” kata pejabat senior departemen kesehatan. Menurut para pejabat, SPHL sedang menunggu persetujuan untuk dimasukkan ke dalam NIV, sebagai salah satu unit laboratorium Nasional.
“Pengujian kualitas sedang dalam tahap akhir. Begitu kami mendapat izin, kami bisa mengikuti sampelnya di sini,” kata Menteri Kesehatan kepada wartawan di Vellore, Rabu. Ahli virologi terkenal Dr T Jacob John mengatakan apa pun variannya, protokol pengobatan untuk Covid-19 tetap sama, tetapi akses terhadap hasilnya akan membantu menentukan seberapa cepat Omicron menyebar. “Ini diperlukan untuk keperluan statistik,” katanya.
Sejauh ini, TN hanya dapat mengkonfirmasi satu kasus Omicron, yaitu seorang pria berusia 47 tahun yang melakukan perjalanan dari Nigeria, pada 15 Desember. Hasil pengurutan 91 sampel dari 104 sampel belum dirilis. Dari 91, 82 sampel, termasuk sampel yang diambil dari enam anggota keluarga pria berusia 47 tahun tersebut, mengalami penurunan gen ‘S’. Sebagian besar sampel dikirim ke laboratorium InStem di Bengaluru. Semua pasien dengan penurunan gen ‘S’ telah diisolasi di Rumah Sakit Corona Pemerintah di King Institute di Guindy atau fasilitas pemerintah lainnya dan dikatakan stabil.
Mantan Direktur Kesehatan Masyarakat, dr. K. Kolandaswamy, mengatakan kebutuhan saat ini adalah masyarakat mendapatkan vaksinasi, menjaga kebersihan tangan, dan mempraktikkan jarak sosial. Setiap orang harus memakai masker di tempat umum. Semua ini adalah satu-satunya cara untuk mencegah penyebaran virus, tambahnya.
Waktu ujian
Apa yang dimaksud dengan pengurutan seluruh genom dan bagaimana cara melakukannya? S Raju, Wakil Direktur Laboratorium Kesehatan Masyarakat Negara menjelaskan…
Apa yang dimaksud dengan pengurutan seluruh genom?
Ini adalah prosedur lanjutan yang mengurutkan asam nukleat (DNA atau RNA). Ini melibatkan pencarian urutan nukleotida, bahan penyusun dasar RNA atau DNA, untuk mengetahui apakah ada perubahan dalam urutannya. Secara efektif, dalam konteks virus SARS-CoV-2, seluruh genom RNA (satu set lengkap informasi genetiknya) diurutkan
Berapa lama proses ini berlangsung?
Maksimal tujuh hari. Persiapan perpustakaan saja bisa memakan waktu hingga tiga hingga empat hari, termasuk pemeriksaan kualitas sampel secara manual. Bahan habis pakai WGS untuk setiap sampel berharga hampir Rs 4.000-4.500. Laboratorium dapat mengurutkan 150 sampel per minggu. Sampel selanjutnya dikirim ke laboratorium pengurutan lainnya
Bagaimana WGS dilakukan?
Sampel Covid-19+ve dari seseorang dikirim untuk WGS
Dari sampel +ve, RNA diekstraksi dan diubah menjadi DNA komplementer (cDNA) dalam mesin yang disebut Ion Chef, di mana chip Ion dimuat.
Di Ion Chef, potongan cDNA kemudian ditambahkan ke adaptor ion beserta reagen yang dapat memfasilitasi reaksi. Ini disebut persiapan perpustakaan
Setelah ini selesai, Chip Ion dikeluarkan dan dimasukkan ke dalam mesin sequencer
Mesin pengurutan melakukan analisis bioinformatika dan menyediakan data urutan dalam file yang akan dianalisis oleh komputer
Komputer memberikan hasil akhir
Mengapa WGS dilakukan?
Hal ini dilakukan untuk mengidentifikasi mutasi pada virus. Virus sering mengalami mutasi dalam rangka mengubah susunan informasi genetik dasar
Kasus Covid-19 di TN
- Kasus baru 604
- Kematian 8
- TPR 0,59%
- Tes 1,01,713
- Diberhentikan 26,97,939
- Jumlah kematian 36.699
- Aktif 6.979
- Total tes 5,65,18,363
Ikuti saluran The New Indian Express di WhatsApp